Il Museo della Figurina ha origine all'interno della nota azienda dei fratelli Panini, fondata a Modena nel 1961. In particolare, fu Giuseppe Panini, ideatore della figurina in senso moderno, l'artefice di questa raccolta di esemplari storici provenienti da tutto il mondo.
Le collezioni che ne compongono il patrimonio, tra i più importanti del mondo, sono state donate nel 1992 alla città di Modena, eletta capitale mondiale della figurina e quindi sede naturale di un museo che ne potesse documentare le origini e lo sviluppo. Negli anni a seguire l'attività del museo si è incentrata sopratutto sulla conservazione e catalogazione della raccolta.
Dal 2005 il museo si è trasferito nei nuovi spazi di Palazzo Santa Margherita, inaugurati il 15 dicembre 2006, per mostrare al pubblico quel mondo sorprendente composto dalla produzione di piccole stampe che, partendo dalla seconda metà dell'Ottocento fino ad arrivare ai giorni nostri, rappresenta non solo la memoria e le emozioni assopite dentro ad ognuno di noi, ma offre stimoli e sorprese inaspettate.